Lavate le melanzane, asciugatele, spuntatele e tagliatele a rondelle; mettetele in un colapasta, salatele e lasciatele riposare per un'ora. Togliete ai pomodori pelle, semi e acqua di vegetazione, quindi tritateli grossolanamente. Sbucciate e tritate la cipolla, sbucciate l'aglio.

In un tegame con 2 cucchiai di olio fate appassire la cipolla e l'aglio, aggiungete i pomodori e il basilico lavato e spezzettato, salate e pepate e fate cuocere per 20 minuti, mescolando di tanto in tanto. Portate a ebollizione abbondante acqua salata e fatevi cuocere le zite. Scolatele al dente, irroratele con 2 cucchiai di olio, affinché non attacchino.

Passate le melanzane in acqua fredda e asciugatele, spennellate d'olio una padella di ghisa e fatele leggermente dorare dalle due parti. Scolatele e tenetele da parte. Distribuite metà della pasta in una pirofila, cospargetevi una parte della salsa di pomodoro; adagiatevi sopra metà delle melanzane e cospargete con poco formaggio grattugiato.

Ricoprite con la rimanente pasta e ripetete l'operazione fino a esaurimento degli ingredienti. Tenete da parte 3 fette di melanzane. Ponete la pirofila in forno preriscaldato a 180 °C per 10-15 minuti, facendo leggermente gratinare. Servite la pasta calda dopo avervi adagiato sopra le tre fette di melanzane tenute da parte.